商业保理按照业务操作方式的不同可以分为有追索权和无追索权的保理;明保理和暗保理;折扣保理和到期保理。
有追索权的保理：是指债权人将应收账款的债权转让给保理商，供应商在得到款项之后，如果购货商拒绝付款或无力付款，保理商有权向债权人进行追索，要求偿还预付的货币资金。
无追索权的保理：是由保理商独自承担债务人拒绝付款或无力付款的风险。债权人在与保理商开展了保理业务之后就等于将全部的风险转嫁给了保理商。
明保理：是指债权人在债权转让的时候应立即将保理情况告知债务人，并指示债务人将货款直接付给保理商。
折扣保理：又称为融资保理，是指当债权人(销售商)将代表应收账款的票据交给保理商时，保理商立即以预付款方式向债权人提供不超过应收账款80%的融资，剩余20%的应收账款待保理商向债务人(买方)收取全部货款后，再行清算。这是比较典型的保理方式。
目前我国商业保理通常有两种运行模式， 一种是由卖方发起的保理，其目的是对资金来源加以掌控。而这种保理模式控制流程与银行保理一定相似性，尽管保理商会对卖方信息进行核定，但却不能充分确保每个买方均有支付意愿及能力，据此，为消除个别买方存在的不确定性，保理商就必须从其他买方回款中来确保账款自偿性，以平衡或抵消个别买方的损失。 第二种模式则是由买方发起的保理，这种保理模式在银行十分常见，很多银行称之为“反向保理”，这种模式比较容易控制银行款的风险，不仅满足了中小企业短期资金的需求，增强了中小企业的生产稳定性和品质保证，而且有利于整个供应链的持续运作和价格竞争力。